Protein–RNA interactions for Protein: Q5STT6

Fam71b, Protein FAM71B, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71bQ5STT6 Snd1-201ENSMUST00000001460 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fam71bQ5STT6 Fan1-201ENSMUST00000163289 3460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fam71bQ5STT6 Osbpl7-206ENSMUST00000168565 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fam71bQ5STT6 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fam71bQ5STT6 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fam71bQ5STT6 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fam71bQ5STT6 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fam71bQ5STT6 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fam71bQ5STT6 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fam71bQ5STT6 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fam71bQ5STT6 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Fam71bQ5STT6 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fam71bQ5STT6 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fam71bQ5STT6 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fam71bQ5STT6 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fam71bQ5STT6 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fam71bQ5STT6 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fam71bQ5STT6 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fam71bQ5STT6 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fam71bQ5STT6 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Fam71bQ5STT6 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Fam71bQ5STT6 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Fam71bQ5STT6 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fam71bQ5STT6 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Fam71bQ5STT6 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fam71bQ5STT6 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fam71bQ5STT6 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Fam71bQ5STT6 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fam71bQ5STT6 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fam71bQ5STT6 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fam71bQ5STT6 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fam71bQ5STT6 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fam71bQ5STT6 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fam71bQ5STT6 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Fam71bQ5STT6 Cish-201ENSMUST00000085102 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fam71bQ5STT6 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fam71bQ5STT6 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fam71bQ5STT6 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fam71bQ5STT6 Gm7103-201ENSMUST00000195642 1852 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Fam71bQ5STT6 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fam71bQ5STT6 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fam71bQ5STT6 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fam71bQ5STT6 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fam71bQ5STT6 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fam71bQ5STT6 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fam71bQ5STT6 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fam71bQ5STT6 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fam71bQ5STT6 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fam71bQ5STT6 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fam71bQ5STT6 Oprm1-213ENSMUST00000105604 1616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fam71bQ5STT6 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fam71bQ5STT6 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fam71bQ5STT6 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fam71bQ5STT6 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fam71bQ5STT6 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fam71bQ5STT6 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fam71bQ5STT6 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fam71bQ5STT6 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fam71bQ5STT6 Add2-210ENSMUST00000205034 3266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fam71bQ5STT6 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fam71bQ5STT6 Sycp2l-201ENSMUST00000124093 2641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fam71bQ5STT6 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fam71bQ5STT6 Tom1l2-203ENSMUST00000093048 4864 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fam71bQ5STT6 Numb-210ENSMUST00000154043 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fam71bQ5STT6 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fam71bQ5STT6 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fam71bQ5STT6 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fam71bQ5STT6 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fam71bQ5STT6 Nt5c1b-217ENSMUST00000219826 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fam71bQ5STT6 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fam71bQ5STT6 Sun1-205ENSMUST00000110883 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fam71bQ5STT6 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fam71bQ5STT6 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fam71bQ5STT6 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fam71bQ5STT6 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fam71bQ5STT6 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Fam71bQ5STT6 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fam71bQ5STT6 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fam71bQ5STT6 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fam71bQ5STT6 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fam71bQ5STT6 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fam71bQ5STT6 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fam71bQ5STT6 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fam71bQ5STT6 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Fam71bQ5STT6 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fam71bQ5STT6 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fam71bQ5STT6 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Fam71bQ5STT6 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fam71bQ5STT6 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fam71bQ5STT6 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fam71bQ5STT6 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Fam71bQ5STT6 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fam71bQ5STT6 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fam71bQ5STT6 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fam71bQ5STT6 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fam71bQ5STT6 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fam71bQ5STT6 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fam71bQ5STT6 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fam71bQ5STT6 Dcun1d4-203ENSMUST00000113558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fam71bQ5STT6 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms