Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZC9

Syne3, Nesprin-3, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne3Q4FZC9 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 265 ms