Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Rad51c-202ENSMUST00000067692 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Gm26848-201ENSMUST00000181052 2467 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Gm12998-201ENSMUST00000122445 789 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Prl2c5-204ENSMUST00000151144 623 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Gm20528-202ENSMUST00000174821 802 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Gm29640-201ENSMUST00000187972 278 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Gm28096-201ENSMUST00000191391 824 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Gm7972-201ENSMUST00000208434 1137 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Speer6-ps1-203ENSMUST00000223482 979 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Eqtn-201ENSMUST00000030309 1074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Gm43747-201ENSMUST00000201412 1330 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Mrps14-203ENSMUST00000135680 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.6 ms