Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQ97

Gm5460, Predicted gene 5460, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5460Q3UQ97 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
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Gm5460Q3UQ97 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Gm19927-201ENSMUST00000185792 781 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Gm5460Q3UQ97 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Gm5460Q3UQ97 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Gm5460Q3UQ97 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Gm11380-201ENSMUST00000118067 560 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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