Protein–RNA interactions for Protein: Q149B8

Perm1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 807 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Perm1Q149B8 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Perm1Q149B8 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Perm1Q149B8 4930579F01Rik-202ENSMUST00000199293 1598 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Perm1Q149B8 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Perm1Q149B8 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Perm1Q149B8 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Perm1Q149B8 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Perm1Q149B8 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Perm1Q149B8 Nr4a2-201ENSMUST00000028166 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Perm1Q149B8 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Perm1Q149B8 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Perm1Q149B8 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Perm1Q149B8 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Perm1Q149B8 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Perm1Q149B8 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Perm1Q149B8 Gm15965-201ENSMUST00000123318 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Perm1Q149B8 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Perm1Q149B8 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Perm1Q149B8 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Perm1Q149B8 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Perm1Q149B8 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Perm1Q149B8 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Perm1Q149B8 Gm42858-201ENSMUST00000202512 1704 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Perm1Q149B8 Gm26848-201ENSMUST00000181052 2467 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Perm1Q149B8 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Perm1Q149B8 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Perm1Q149B8 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Perm1Q149B8 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Perm1Q149B8 Gm11540-201ENSMUST00000117457 780 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Perm1Q149B8 Gm5510-201ENSMUST00000117826 486 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Perm1Q149B8 Myl1-203ENSMUST00000120415 621 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Perm1Q149B8 Gm20694-201ENSMUST00000176943 404 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Perm1Q149B8 Vmn2r-ps9-201ENSMUST00000177446 1099 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Perm1Q149B8 Kif4-ps-202ENSMUST00000185083 652 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Perm1Q149B8 BC025446-202ENSMUST00000185307 758 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Perm1Q149B8 Gm43117-201ENSMUST00000198531 379 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Perm1Q149B8 Gm45893-201ENSMUST00000211899 247 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Perm1Q149B8 Thy1-205ENSMUST00000215156 460 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Perm1Q149B8 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Perm1Q149B8 AC132446.1-201ENSMUST00000222655 226 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Perm1Q149B8 AC154433.1-201ENSMUST00000224401 1183 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Perm1Q149B8 Ggta1-201ENSMUST00000044255 1221 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Perm1Q149B8 Fthl17e-201ENSMUST00000096509 841 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Perm1Q149B8 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Perm1Q149B8 Itpa-201ENSMUST00000103193 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Perm1Q149B8 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Perm1Q149B8 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Perm1Q149B8 Il33-201ENSMUST00000025724 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Perm1Q149B8 Ino80dos-201ENSMUST00000138611 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Perm1Q149B8 Cxcl11-201ENSMUST00000077820 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Perm1Q149B8 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Perm1Q149B8 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Perm1Q149B8 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Perm1Q149B8 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Perm1Q149B8 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Perm1Q149B8 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Perm1Q149B8 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Perm1Q149B8 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Perm1Q149B8 Tfpi2-201ENSMUST00000031674 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Perm1Q149B8 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Perm1Q149B8 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Perm1Q149B8 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Perm1Q149B8 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Perm1Q149B8 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Perm1Q149B8 Cav2-203ENSMUST00000115462 694 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Perm1Q149B8 Gm11473-201ENSMUST00000118980 359 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Perm1Q149B8 Defa-ps17-201ENSMUST00000121849 171 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Perm1Q149B8 4933403O08Rik-201ENSMUST00000132037 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Perm1Q149B8 Gm17207-201ENSMUST00000168686 645 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Perm1Q149B8 Gm26957-201ENSMUST00000182645 977 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Perm1Q149B8 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Perm1Q149B8 1700019D03Rik-205ENSMUST00000190726 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Perm1Q149B8 Gm43106-201ENSMUST00000199485 637 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Perm1Q149B8 Madcam1-202ENSMUST00000217748 944 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Perm1Q149B8 Gm8768-201ENSMUST00000220020 826 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Perm1Q149B8 Gm26861-207ENSMUST00000223253 1095 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Perm1Q149B8 Rps9-201ENSMUST00000006496 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Perm1Q149B8 Fabp1-201ENSMUST00000067492 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Perm1Q149B8 Ifnl3-201ENSMUST00000078364 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Perm1Q149B8 Gm6304-201ENSMUST00000096579 447 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Perm1Q149B8 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Perm1Q149B8 Tstd2-201ENSMUST00000107770 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Perm1Q149B8 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Perm1Q149B8 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Perm1Q149B8 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Perm1Q149B8 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Perm1Q149B8 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Perm1Q149B8 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Perm1Q149B8 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Perm1Q149B8 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Perm1Q149B8 Gm15984-202ENSMUST00000156466 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Perm1Q149B8 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Perm1Q149B8 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Perm1Q149B8 Gm8873-201ENSMUST00000217847 1439 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Perm1Q149B8 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Perm1Q149B8 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Perm1Q149B8 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Perm1Q149B8 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Perm1Q149B8 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Perm1Q149B8 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms