Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 F730016J06Rik-201ENSMUST00000126140 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Myc-206ENSMUST00000167731 1821 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Cct3-201ENSMUST00000001452 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Gm10643-201ENSMUST00000098592 1577 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Gm7047-201ENSMUST00000196224 1063 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 E330021D16Rik-201ENSMUST00000058713 1116 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Vmn1r212-201ENSMUST00000095960 1164 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Gm15651-201ENSMUST00000159953 2507 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Gm4812-201ENSMUST00000182847 993 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms