Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Gm42714-201ENSMUST00000202063 1364 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 AU019990-202ENSMUST00000143964 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Gm15185-201ENSMUST00000117397 746 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Olfr1060-ps1-201ENSMUST00000118335 943 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Gm11991-201ENSMUST00000119652 1074 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Tctex1d1-203ENSMUST00000125417 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Gm10267-202ENSMUST00000181652 341 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Gm28622-201ENSMUST00000189842 507 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 AL929285.1-201ENSMUST00000215522 229 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 CT009600.2-201ENSMUST00000226638 481 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Tctex1d1-201ENSMUST00000030248 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Olfr720-201ENSMUST00000035250 1023 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Spinkl-201ENSMUST00000066328 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Vmn1r125-201ENSMUST00000098739 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Olfr1217-201ENSMUST00000099799 1105 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Lrrc3b-202ENSMUST00000163937 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Olfr781-202ENSMUST00000204108 1304 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 AC153143.1-201ENSMUST00000222966 1340 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Rfc4-203ENSMUST00000115338 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Gm15656-201ENSMUST00000132076 615 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Gm15819-201ENSMUST00000153089 481 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Gm4778-202ENSMUST00000159517 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Vmn1r-ps46-201ENSMUST00000173862 949 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Gm42936-201ENSMUST00000174019 652 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Gm10715-202ENSMUST00000177969 681 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Olfr8-202ENSMUST00000203851 1009 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Gm31904-201ENSMUST00000219446 877 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 AC163296.1-201ENSMUST00000220004 1266 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Enkur-201ENSMUST00000027992 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Gm10704-201ENSMUST00000098952 730 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms