Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Gm16048-201ENSMUST00000134250 663 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Gm17226-201ENSMUST00000166637 780 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Gm42511-201ENSMUST00000196160 234 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Gm43564-201ENSMUST00000196185 211 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Gm6352-201ENSMUST00000203583 1134 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 AC154759.1-201ENSMUST00000224137 1159 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Olfr1015-201ENSMUST00000047870 1016 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Tprg-201ENSMUST00000056087 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Gm6564-201ENSMUST00000075377 619 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 n-R5s71-201ENSMUST00000093668 119 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Nt5dc1-202ENSMUST00000099973 761 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Ppm1b-203ENSMUST00000112305 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Gm42535-201ENSMUST00000197312 1399 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Ighv13-1-201ENSMUST00000103480 294 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Atp5g3-202ENSMUST00000111996 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Gm12947-201ENSMUST00000116114 420 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Sox5it-201ENSMUST00000144026 1207 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Gm13412-201ENSMUST00000150621 677 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Treml4-206ENSMUST00000154335 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Cd9-ps-201ENSMUST00000174687 650 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
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NfiaQ02780 Gm5210-201ENSMUST00000182150 1010 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Gm7572-201ENSMUST00000182616 766 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Ghrl-205ENSMUST00000204163 447 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Gm44640-201ENSMUST00000206894 247 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Gm45680-201ENSMUST00000211135 214 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Rnasek-201ENSMUST00000040428 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
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NfiaQ02780 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
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NfiaQ02780 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
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NfiaQ02780 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Gm8050-201ENSMUST00000171987 1595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
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NfiaQ02780 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
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NfiaQ02780 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Pdzk1ip1-202ENSMUST00000106548 887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Mir1249-201ENSMUST00000116791 98 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Gm24078-201ENSMUST00000158184 103 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Vmn1r-ps144-201ENSMUST00000177291 939 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
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