Protein–RNA interactions for Protein: Q02525

Zfp39, Zinc finger protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp39Q02525 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Zfp39Q02525 Slc25a44-204ENSMUST00000195657 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Zfp39Q02525 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Zfp39Q02525 4930417O13Rik-203ENSMUST00000204911 3458 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Zfp39Q02525 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Zfp39Q02525 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Zfp39Q02525 Gm26797-202ENSMUST00000213132 2562 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Zfp39Q02525 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Zfp39Q02525 Tmem67-202ENSMUST00000108293 3945 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Zfp39Q02525 Adgrf3-201ENSMUST00000088117 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Zfp39Q02525 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Zfp39Q02525 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Zfp39Q02525 Zfp512-201ENSMUST00000076264 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Zfp39Q02525 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Zfp39Q02525 Aco2-201ENSMUST00000023116 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Zfp39Q02525 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Zfp39Q02525 Pax6-206ENSMUST00000111086 2601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Zfp39Q02525 Bcat1-203ENSMUST00000111742 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Zfp39Q02525 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Zfp39Q02525 Cx3cl1-201ENSMUST00000034230 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Zfp39Q02525 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Zfp39Q02525 Gm23061-201ENSMUST00000102348 116 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Zfp39Q02525 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Zfp39Q02525 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Zfp39Q02525 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Zfp39Q02525 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Zfp39Q02525 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Zfp39Q02525 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Zfp39Q02525 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Zfp39Q02525 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Zfp39Q02525 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Zfp39Q02525 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Zfp39Q02525 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Zfp39Q02525 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Zfp39Q02525 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Zfp39Q02525 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Zfp39Q02525 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Zfp39Q02525 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Zfp39Q02525 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Zfp39Q02525 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Zfp39Q02525 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Zfp39Q02525 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Zfp39Q02525 Srpx2-201ENSMUST00000033606 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Zfp39Q02525 Eef2k-204ENSMUST00000106489 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Zfp39Q02525 Pip5k1a-201ENSMUST00000005768 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Zfp39Q02525 Morf4l2-201ENSMUST00000033797 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Zfp39Q02525 Mybpc3-201ENSMUST00000111430 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Zfp39Q02525 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Zfp39Q02525 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Zfp39Q02525 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Zfp39Q02525 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Zfp39Q02525 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Zfp39Q02525 Abcg1-201ENSMUST00000024829 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Zfp39Q02525 Slc7a3-202ENSMUST00000101362 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Zfp39Q02525 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Zfp39Q02525 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Zfp39Q02525 Dusp16-202ENSMUST00000129433 3993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Zfp39Q02525 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Zfp39Q02525 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp39Q02525 Amph-201ENSMUST00000003345 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp39Q02525 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp39Q02525 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp39Q02525 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp39Q02525 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp39Q02525 Gm44798-201ENSMUST00000208123 2410 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp39Q02525 Gm364-201ENSMUST00000114725 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp39Q02525 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp39Q02525 Bfar-201ENSMUST00000023365 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp39Q02525 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp39Q02525 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp39Q02525 Echdc1-201ENSMUST00000020034 3856 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp39Q02525 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp39Q02525 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp39Q02525 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp39Q02525 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp39Q02525 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp39Q02525 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp39Q02525 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp39Q02525 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp39Q02525 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp39Q02525 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp39Q02525 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp39Q02525 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp39Q02525 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp39Q02525 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp39Q02525 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp39Q02525 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp39Q02525 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp39Q02525 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp39Q02525 Adat1-201ENSMUST00000034427 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp39Q02525 Gpr155-204ENSMUST00000112044 4201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp39Q02525 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp39Q02525 Nemp2-201ENSMUST00000165859 3396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp39Q02525 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp39Q02525 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp39Q02525 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp39Q02525 Ppp1r26-205ENSMUST00000189694 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp39Q02525 Ppp1r26-201ENSMUST00000040324 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp39Q02525 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp39Q02525 Dmtn-203ENSMUST00000110984 4176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.6 ms