Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Dnaja1-201ENSMUST00000030118 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Bgn-207ENSMUST00000169489 1574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Use1-203ENSMUST00000110054 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Rps18-ps1-201ENSMUST00000120838 459 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Gm13842-202ENSMUST00000156331 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Gm37141-201ENSMUST00000191938 422 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Gm19566-201ENSMUST00000199576 610 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Gm46349-201ENSMUST00000219678 917 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Gm38048-201ENSMUST00000193778 2174 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Rffl-201ENSMUST00000021036 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Gm23062-201ENSMUST00000102349 110 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Rpl7a-ps11-201ENSMUST00000118791 801 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Gm34248-201ENSMUST00000200027 474 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Gm44917-201ENSMUST00000208798 520 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Gm2716-201ENSMUST00000212350 643 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 CU025215.1-201ENSMUST00000222986 603 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 AC153153.1-201ENSMUST00000225803 793 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Gstm2-202ENSMUST00000066530 854 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Gm16477-201ENSMUST00000085365 801 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Gm17415-201ENSMUST00000096427 789 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Gm12097-201ENSMUST00000121523 1414 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Gm5174-201ENSMUST00000171131 1423 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Cenpx-204ENSMUST00000106155 700 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Gm8216-201ENSMUST00000117232 601 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Gm11521-201ENSMUST00000143302 329 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Chn2-209ENSMUST00000146114 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Gm7672-201ENSMUST00000180915 872 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Mir7088-201ENSMUST00000184227 86 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Gm40332-201ENSMUST00000199847 938 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Smim23-201ENSMUST00000020508 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Gm19605-205ENSMUST00000221712 677 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 AC102327.1-201ENSMUST00000226389 742 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Gm5148-201ENSMUST00000079755 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Gm36211-201ENSMUST00000198171 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Dhdds-209ENSMUST00000144668 3219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Olfr333-ps1-201ENSMUST00000122311 940 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Morf4l2-213ENSMUST00000166478 1720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Gm28916-201ENSMUST00000186988 699 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Gm29593-201ENSMUST00000189827 620 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Gm31466-201ENSMUST00000195457 916 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 AC242269.1-201ENSMUST00000227020 741 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Gm10617-201ENSMUST00000098368 1172 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Gemin8-202ENSMUST00000087169 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Babam2-202ENSMUST00000071531 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Dmtf1-201ENSMUST00000071921 3806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.7 ms