Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Gm8914-201ENSMUST00000101396 1035 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Gm5071-201ENSMUST00000104922 1035 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Cenpx-204ENSMUST00000106155 700 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Rpain-202ENSMUST00000108529 282 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Dtymk-203ENSMUST00000112893 1040 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Gm14152-201ENSMUST00000127020 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Gm9117-201ENSMUST00000177735 1098 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 1700065O20Rik-201ENSMUST00000186872 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Gm46329-201ENSMUST00000218373 609 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Gm5072-201ENSMUST00000063726 1035 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Ccdc65-201ENSMUST00000003444 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Ankrd36-201ENSMUST00000109855 1363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Gm8848-201ENSMUST00000197270 1343 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Ifna5-201ENSMUST00000102804 570 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Zbp1-202ENSMUST00000109116 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Snx10-202ENSMUST00000114439 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Gm11701-201ENSMUST00000121277 1142 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Eif4a-ps4-201ENSMUST00000122226 1218 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Gm3687-201ENSMUST00000161710 460 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 D130017N08Rik-201ENSMUST00000180460 510 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Gm2021-201ENSMUST00000190623 464 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Gm44716-201ENSMUST00000209007 710 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 CT025547.1-201ENSMUST00000225127 578 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Gm26205-201ENSMUST00000082907 134 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Gm4925-202ENSMUST00000168843 1561 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Fut8-202ENSMUST00000171770 2765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Adh1-201ENSMUST00000004232 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Gm45871-204ENSMUST00000211710 2003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Gm45110-201ENSMUST00000205704 1402 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Spert-201ENSMUST00000035243 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Gm43052-201ENSMUST00000201451 1628 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Nbdy-204ENSMUST00000185492 1346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Gm3880-201ENSMUST00000122154 337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Rpl17-ps11-201ENSMUST00000161946 729 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Gm8625-201ENSMUST00000194185 1077 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 AC156274.1-201ENSMUST00000219193 634 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 3110083C13Rik-202ENSMUST00000224786 907 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Tceanc2-203ENSMUST00000058585 766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Rps18-201ENSMUST00000008812 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 1110017D15Rik-202ENSMUST00000095126 884 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Gm10344-201ENSMUST00000193498 1419 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 4930432L08Rik-201ENSMUST00000132154 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Myc-208ENSMUST00000191178 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 6030469F06Rik-202ENSMUST00000218473 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Ifna6-201ENSMUST00000105146 570 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Gm14853-201ENSMUST00000116081 549 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Gm12489-201ENSMUST00000119364 148 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Tsc22d3-204ENSMUST00000123898 952 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 A630023P12Rik-203ENSMUST00000141532 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Pttg1ip-208ENSMUST00000162943 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Ifna11-201ENSMUST00000170428 573 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Gm32772-203ENSMUST00000207022 675 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 AC124772.3-201ENSMUST00000222535 575 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Gm46376-201ENSMUST00000222653 654 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 3830406C13Rik-205ENSMUST00000223702 900 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Gzmf-201ENSMUST00000022757 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Sun5-201ENSMUST00000028982 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Olfr128-201ENSMUST00000080231 1050 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Ifna1-201ENSMUST00000094972 570 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms