Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

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Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gabpb2P81069 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gabpb2P81069 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Gabpb2P81069 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Gabpb2P81069 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gabpb2P81069 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gabpb2P81069 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gabpb2P81069 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gabpb2P81069 Wdr60-201ENSMUST00000039349 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gabpb2P81069 Thbd-201ENSMUST00000099270 3723 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gabpb2P81069 Sec16a-201ENSMUST00000091252 8737 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gabpb2P81069 Foxm1-202ENSMUST00000112148 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gabpb2P81069 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gabpb2P81069 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gabpb2P81069 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gabpb2P81069 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gabpb2P81069 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gabpb2P81069 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gabpb2P81069 Gm23958-201ENSMUST00000157207 105 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gabpb2P81069 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gabpb2P81069 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gabpb2P81069 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gabpb2P81069 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gabpb2P81069 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gabpb2P81069 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gabpb2P81069 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gabpb2P81069 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gabpb2P81069 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gabpb2P81069 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gabpb2P81069 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gabpb2P81069 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gabpb2P81069 Dip2c-202ENSMUST00000169960 4801 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gabpb2P81069 Wnk1-204ENSMUST00000088646 8364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gabpb2P81069 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gabpb2P81069 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gabpb2P81069 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gabpb2P81069 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gabpb2P81069 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gabpb2P81069 Ccdc40-201ENSMUST00000035935 4979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gabpb2P81069 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gabpb2P81069 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gabpb2P81069 Tmem126b-201ENSMUST00000032843 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gabpb2P81069 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gabpb2P81069 Mst1r-201ENSMUST00000035203 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gabpb2P81069 Morc2a-201ENSMUST00000093389 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gabpb2P81069 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gabpb2P81069 Cadm2-201ENSMUST00000114292 9564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gabpb2P81069 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gabpb2P81069 Hyal2-206ENSMUST00000195681 2968 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gabpb2P81069 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gabpb2P81069 Pigk-204ENSMUST00000159899 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gabpb2P81069 Gm16070-201ENSMUST00000127328 5210 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gabpb2P81069 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gabpb2P81069 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gabpb2P81069 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gabpb2P81069 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gabpb2P81069 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gabpb2P81069 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gabpb2P81069 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gabpb2P81069 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gabpb2P81069 Tbata-210ENSMUST00000151886 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gabpb2P81069 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gabpb2P81069 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gabpb2P81069 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gabpb2P81069 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gabpb2P81069 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gabpb2P81069 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gabpb2P81069 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gabpb2P81069 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gabpb2P81069 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gabpb2P81069 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gabpb2P81069 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gabpb2P81069 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gabpb2P81069 Actbl2-201ENSMUST00000054716 2737 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gabpb2P81069 Gm13126-201ENSMUST00000117079 3063 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gabpb2P81069 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gabpb2P81069 9330175E14Rik-201ENSMUST00000180445 4852 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gabpb2P81069 Lct-201ENSMUST00000073490 6174 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gabpb2P81069 Ralgps1-201ENSMUST00000042615 6029 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gabpb2P81069 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gabpb2P81069 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gabpb2P81069 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gabpb2P81069 Anxa7-201ENSMUST00000065504 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gabpb2P81069 Uaca-201ENSMUST00000050183 4428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gabpb2P81069 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gabpb2P81069 Adamts9-205ENSMUST00000167391 6033 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gabpb2P81069 Pum1-201ENSMUST00000030315 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gabpb2P81069 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gabpb2P81069 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gabpb2P81069 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gabpb2P81069 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gabpb2P81069 Brpf1-208ENSMUST00000203577 4468 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gabpb2P81069 Gm43339-201ENSMUST00000200032 1606 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Gabpb2P81069 Traf3-201ENSMUST00000021706 7060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gabpb2P81069 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gabpb2P81069 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gabpb2P81069 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Gabpb2P81069 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gabpb2P81069 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gabpb2P81069 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms