Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 AI839979-201ENSMUST00000200738 654 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
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PtpreP49446 Gm43263-201ENSMUST00000201619 560 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Gm44777-203ENSMUST00000206930 571 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtpreP49446 AC162938.2-202ENSMUST00000215497 722 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Gm40761-201ENSMUST00000219123 1153 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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PtpreP49446 Acot13-201ENSMUST00000006900 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtpreP49446 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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PtpreP49446 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PtpreP49446 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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PtpreP49446 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Clec12b-202ENSMUST00000112082 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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PtpreP49446 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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PtpreP49446 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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PtpreP49446 Cd55b-202ENSMUST00000119432 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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PtpreP49446 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PtpreP49446 4930557J02Rik-201ENSMUST00000202325 1075 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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PtpreP49446 Gm5907-202ENSMUST00000210969 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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PtpreP49446 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Ctrl-201ENSMUST00000034368 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Ensa-202ENSMUST00000058230 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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PtpreP49446 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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PtpreP49446 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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PtpreP49446 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
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PtpreP49446 Timm21-201ENSMUST00000025547 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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PtpreP49446 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Gm24279-201ENSMUST00000104236 131 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Dcpp3-201ENSMUST00000115428 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Gm12461-201ENSMUST00000120231 1239 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
PtpreP49446 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PtpreP49446 7420461P10Rik-201ENSMUST00000169439 781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Gm8384-201ENSMUST00000190905 704 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Gm28096-201ENSMUST00000191391 824 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
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