Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Epb42P49222 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Zfp965-202ENSMUST00000109042 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Zfp973-202ENSMUST00000121956 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Gm12811-201ENSMUST00000125237 667 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Gm7714-201ENSMUST00000169154 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Vmn1r-ps78-201ENSMUST00000178185 924 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Vmn1r-ps76-201ENSMUST00000179492 924 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Epb42P49222 1700003H04Rik-206ENSMUST00000180162 1086 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Gm28934-201ENSMUST00000186491 346 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Lilrb4a-205ENSMUST00000217705 1142 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Gm18026-201ENSMUST00000222789 727 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Epb42P49222 AC132918.1-201ENSMUST00000227877 925 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Epb42P49222 1700003H04Rik-201ENSMUST00000047110 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Mterf1a-201ENSMUST00000044746 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Gm44090-201ENSMUST00000204669 1834 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Epb42P49222 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Pdgfra-202ENSMUST00000168162 6834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Epb42P49222 9630028H03Rik-202ENSMUST00000153402 1559 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Gm10558-201ENSMUST00000147494 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Gm5916-201ENSMUST00000168452 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Gm17075-201ENSMUST00000171924 670 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Epb42P49222 4932441J04Rik-201ENSMUST00000180708 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Gm28199-201ENSMUST00000187127 619 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Epb42P49222 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Gm37560-201ENSMUST00000194289 1000 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Gm38154-201ENSMUST00000195444 340 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Epb42P49222 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Gm35615-201ENSMUST00000221255 719 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Epb42P49222 AC154361.1-201ENSMUST00000225694 745 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Epb42P49222 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Olfr829-201ENSMUST00000058411 966 ntAPPRIS P2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Ccdc68-202ENSMUST00000080050 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Gm37891-201ENSMUST00000195585 1326 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Gm11342-203ENSMUST00000224879 1324 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Epb42P49222 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms