Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Cpvl-202ENSMUST00000203101 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SrprbP47758 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SrprbP47758 4930432L08Rik-201ENSMUST00000132154 1608 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Vangl1-208ENSMUST00000168312 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Gm28624-201ENSMUST00000186430 2131 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
SrprbP47758 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SrprbP47758 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Gm5944-201ENSMUST00000118182 1001 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
SrprbP47758 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Eif2s3y-201ENSMUST00000091197 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Mei4-203ENSMUST00000189832 2578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Myc-206ENSMUST00000167731 1821 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SrprbP47758 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
SrprbP47758 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Olfr225-201ENSMUST00000055276 1260 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
SrprbP47758 C2-206ENSMUST00000152417 2157 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms