Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Gm7732-201ENSMUST00000170486 1527 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Gm7740-201ENSMUST00000186171 1527 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Gm7736-201ENSMUST00000096981 1527 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Cfap61-204ENSMUST00000126415 2256 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Itgad-201ENSMUST00000033051 3965 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Cyp7b1-201ENSMUST00000035625 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Piwil1-202ENSMUST00000195959 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Dcun1d2-202ENSMUST00000110838 2955 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 March10-204ENSMUST00000138977 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Itih3-205ENSMUST00000227995 2100 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Avil-203ENSMUST00000129173 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Olfr6-203ENSMUST00000213651 4457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Slc35a4-206ENSMUST00000186538 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Wars-205ENSMUST00000161410 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 G3bp1-201ENSMUST00000018727 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Plec-215ENSMUST00000169108 14853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Cdc23-203ENSMUST00000133181 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Henmt1-203ENSMUST00000106586 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Wnk1-224ENSMUST00000203030 8163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Med24-202ENSMUST00000100500 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Smchd1-201ENSMUST00000127430 7052 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Ciapin1-209ENSMUST00000162538 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Birc6-202ENSMUST00000180037 15768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Map2-206ENSMUST00000114017 4981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Ticam1-201ENSMUST00000058136 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Nfkbiz-204ENSMUST00000114458 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Atl2-201ENSMUST00000068282 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Ttc16-206ENSMUST00000161430 2874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 A630052C17Rik-201ENSMUST00000129876 2203 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Wdr62-201ENSMUST00000108190 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Gm43274-201ENSMUST00000202545 5000 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Arfgap3-201ENSMUST00000067215 2619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Ccdc85a-206ENSMUST00000146385 3798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Gm40634-201ENSMUST00000214129 2001 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Elmo3-201ENSMUST00000109375 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Metap1-203ENSMUST00000197531 3708 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Clasp1-208ENSMUST00000187713 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Dctn1-202ENSMUST00000113907 4205 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Aebp1-202ENSMUST00000109829 2541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Tfdp1-204ENSMUST00000209885 2511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Doxl2-203ENSMUST00000184917 2468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Fgf1-202ENSMUST00000115582 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Gm15631-201ENSMUST00000142962 2436 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Ppp2r2a-201ENSMUST00000089230 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Odf2-207ENSMUST00000113762 2353 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 AC122382.1-201ENSMUST00000225869 2371 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Ccdc62-202ENSMUST00000165148 3920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Gm32219-201ENSMUST00000221234 1819 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Cacna1d-204ENSMUST00000223803 6435 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Gm17151-201ENSMUST00000105760 367 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms