Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

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Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Gm19045-201ENSMUST00000222488 1193 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Chd1P40201 A830005F24Rik-201ENSMUST00000065465 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chd1P40201 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chd1P40201 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Chd1P40201 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chd1P40201 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chd1P40201 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chd1P40201 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Chd1P40201 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chd1P40201 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chd1P40201 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chd1P40201 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chd1P40201 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chd1P40201 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chd1P40201 Gm25763-201ENSMUST00000104099 129 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Chd1P40201 Gm12551-201ENSMUST00000122073 726 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Chd1P40201 Gm9458-201ENSMUST00000135273 727 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Chd1P40201 A930019D19Rik-201ENSMUST00000135360 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chd1P40201 Gm14437-201ENSMUST00000152284 360 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chd1P40201 Tpi-rs11-201ENSMUST00000202145 310 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Chd1P40201 Gm28053-203ENSMUST00000204408 351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chd1P40201 Gm44204-201ENSMUST00000204722 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chd1P40201 Flt3l-210ENSMUST00000211246 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chd1P40201 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chd1P40201 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chd1P40201 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chd1P40201 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chd1P40201 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chd1P40201 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chd1P40201 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chd1P40201 Ube2q1-202ENSMUST00000196726 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chd1P40201 Odam-201ENSMUST00000113274 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chd1P40201 Bcas1os2-201ENSMUST00000131931 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chd1P40201 Gm3383-203ENSMUST00000178414 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chd1P40201 Gm3194-201ENSMUST00000180143 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chd1P40201 4930478P22Rik-202ENSMUST00000201921 723 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chd1P40201 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chd1P40201 Cryab-206ENSMUST00000217475 1117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chd1P40201 Gm5951-201ENSMUST00000220283 504 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Chd1P40201 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chd1P40201 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chd1P40201 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chd1P40201 9530026P05Rik-204ENSMUST00000204449 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chd1P40201 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Chd1P40201 Gm14264-201ENSMUST00000147141 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chd1P40201 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chd1P40201 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chd1P40201 Zcchc9-201ENSMUST00000022121 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chd1P40201 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chd1P40201 Gm13623-201ENSMUST00000118359 625 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Chd1P40201 Gm13361-201ENSMUST00000119977 1431 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Chd1P40201 Gm14332-201ENSMUST00000121982 899 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Chd1P40201 Gm13938-201ENSMUST00000156809 493 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Chd1P40201 Gm26619-201ENSMUST00000180396 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Chd1P40201 Mir6354-201ENSMUST00000184979 116 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Chd1P40201 Gm43628-201ENSMUST00000197871 1187 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Chd1P40201 1500002F19Rik-203ENSMUST00000211184 375 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Chd1P40201 Hmg20a-205ENSMUST00000215269 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Chd1P40201 AC160931.1-201ENSMUST00000223298 413 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Chd1P40201 Yipf7-201ENSMUST00000031045 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Chd1P40201 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Chd1P40201 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Mapk1ip1-202ENSMUST00000118810 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Vgll3-202ENSMUST00000227997 1383 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Cyp2b13-201ENSMUST00000005669 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Rsph14-203ENSMUST00000159994 1728 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Hspa12b-202ENSMUST00000100763 628 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Gng12-207ENSMUST00000114228 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Gm16334-201ENSMUST00000159488 694 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Gm26679-201ENSMUST00000181685 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Gm29272-201ENSMUST00000185476 696 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Gm21919-201ENSMUST00000185653 696 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Gm28446-201ENSMUST00000186508 694 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Gm28680-201ENSMUST00000186743 480 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Gm21824-201ENSMUST00000186810 696 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Gm21862-201ENSMUST00000186957 696 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Gm21796-201ENSMUST00000187116 696 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Gm21795-201ENSMUST00000187263 696 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Gm28814-201ENSMUST00000187334 696 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Gm21720-201ENSMUST00000187428 696 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Gm20827-201ENSMUST00000187928 696 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Gm21766-201ENSMUST00000187962 696 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Gm21837-201ENSMUST00000188117 696 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Gm21829-201ENSMUST00000188787 696 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Gm28676-201ENSMUST00000188990 591 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Gm21892-201ENSMUST00000189182 696 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Gm21777-201ENSMUST00000189307 696 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Gm28247-201ENSMUST00000189329 696 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Gm28350-201ENSMUST00000189453 696 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Gm21906-201ENSMUST00000189760 696 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
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