Protein–RNA interactions for Protein: P31310

Hoxa10, Homeobox protein Hox-A10, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa10P31310 Sfxn2-201ENSMUST00000026011 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Atp13a4-201ENSMUST00000039090 2878 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Gm45132-201ENSMUST00000207234 2542 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Gm5046-201ENSMUST00000100608 611 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Ola1-203ENSMUST00000112055 1251 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Gm28347-201ENSMUST00000185380 382 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Gm28750-201ENSMUST00000186327 658 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Gm26801-202ENSMUST00000193187 610 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Gm43867-201ENSMUST00000203860 525 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Olfr46-202ENSMUST00000211771 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 AC154765.1-201ENSMUST00000217732 439 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Prl7d1-201ENSMUST00000021776 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 CT010456.2-201ENSMUST00000222665 1053 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Vmn1r74-201ENSMUST00000050416 915 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Olfr196-201ENSMUST00000077027 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Rims2-204ENSMUST00000226410 3685 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Olfr197-202ENSMUST00000207772 1320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Gm45885-202ENSMUST00000211520 1383 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Qars-203ENSMUST00000134939 2374 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Meox2-201ENSMUST00000041183 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 A1cf-201ENSMUST00000075838 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Tmem74bos-202ENSMUST00000149319 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Gm10558-201ENSMUST00000147494 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Gm17043-201ENSMUST00000164621 1283 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 AC105408.1-201ENSMUST00000227771 802 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Vmn1r226-201ENSMUST00000061756 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Olfr1537-201ENSMUST00000073248 945 ntAPPRIS P2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Csn2-201ENSMUST00000082370 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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