Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RxraP28700 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RxraP28700 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RxraP28700 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RxraP28700 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RxraP28700 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RxraP28700 Ndufb2-205ENSMUST00000135671 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RxraP28700 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RxraP28700 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RxraP28700 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RxraP28700 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RxraP28700 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RxraP28700 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RxraP28700 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RxraP28700 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RxraP28700 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RxraP28700 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RxraP28700 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RxraP28700 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RxraP28700 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RxraP28700 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RxraP28700 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RxraP28700 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RxraP28700 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
RxraP28700 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
RxraP28700 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
RxraP28700 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
RxraP28700 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RxraP28700 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
RxraP28700 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RxraP28700 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RxraP28700 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RxraP28700 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RxraP28700 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
RxraP28700 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
RxraP28700 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
RxraP28700 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
RxraP28700 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RxraP28700 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RxraP28700 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RxraP28700 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RxraP28700 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RxraP28700 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RxraP28700 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RxraP28700 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RxraP28700 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RxraP28700 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
RxraP28700 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RxraP28700 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RxraP28700 8030423F21Rik-201ENSMUST00000064097 2851 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RxraP28700 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RxraP28700 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RxraP28700 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RxraP28700 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RxraP28700 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RxraP28700 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RxraP28700 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RxraP28700 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RxraP28700 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
RxraP28700 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RxraP28700 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RxraP28700 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RxraP28700 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RxraP28700 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RxraP28700 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RxraP28700 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RxraP28700 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RxraP28700 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RxraP28700 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RxraP28700 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RxraP28700 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RxraP28700 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RxraP28700 Anks1b-216ENSMUST00000182430 3305 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RxraP28700 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
RxraP28700 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RxraP28700 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RxraP28700 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RxraP28700 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RxraP28700 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RxraP28700 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RxraP28700 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RxraP28700 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RxraP28700 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
RxraP28700 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
RxraP28700 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RxraP28700 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RxraP28700 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RxraP28700 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RxraP28700 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RxraP28700 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
RxraP28700 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RxraP28700 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RxraP28700 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RxraP28700 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RxraP28700 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
RxraP28700 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RxraP28700 BC035947-201ENSMUST00000170511 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RxraP28700 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RxraP28700 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RxraP28700 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
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