Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Gm15982-201ENSMUST00000121681 554 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Rplp0-ps1-201ENSMUST00000122125 933 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Slc1a3-208ENSMUST00000157065 728 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Gm4462-201ENSMUST00000166453 492 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Gm37851-201ENSMUST00000193871 889 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Gm33707-201ENSMUST00000195135 569 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Gm8643-201ENSMUST00000195228 625 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Gm43811-201ENSMUST00000202862 695 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Gm7904-201ENSMUST00000217049 465 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 AC134537.1-201ENSMUST00000219205 265 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 AC167364.1-201ENSMUST00000221495 784 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 AC101205.2-201ENSMUST00000226206 715 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Izumo1r-202ENSMUST00000069408 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Klk1b24-201ENSMUST00000073713 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Klk1b21-201ENSMUST00000085455 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Eif2c5-201ENSMUST00000125609 1416 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Gm42858-201ENSMUST00000202512 1704 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 AC153524.2-201ENSMUST00000218351 1375 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Micu1-212ENSMUST00000179709 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Skint7-202ENSMUST00000106568 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Bglap3-203ENSMUST00000107543 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Lime1-202ENSMUST00000108804 960 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Gm5510-201ENSMUST00000117826 486 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Pitpnm2os2-201ENSMUST00000159053 828 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Gm16619-201ENSMUST00000181817 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Arl14-201ENSMUST00000183126 1200 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Ighv1-70-201ENSMUST00000196509 351 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Gm18555-201ENSMUST00000197935 584 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 4930486N12Rik-201ENSMUST00000206668 632 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Rp9-204ENSMUST00000216973 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Tbc1d21-201ENSMUST00000040217 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Ttc24-202ENSMUST00000064550 671 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Sectm1b-202ENSMUST00000081499 1222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Sox5os1-201ENSMUST00000156994 1585 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 5730422E09Rik-201ENSMUST00000180733 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Mkrn1-ps1-201ENSMUST00000122035 1390 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms