Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TP20293 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TP20293 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TP20293 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TP20293 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TP20293 Trappc9-202ENSMUST00000089770 4047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TP20293 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TP20293 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TP20293 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
TP20293 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TP20293 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TP20293 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TP20293 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
TP20293 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
TP20293 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
TP20293 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
TP20293 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
TP20293 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
TP20293 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
TP20293 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
TP20293 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TP20293 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
TP20293 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TP20293 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
TP20293 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TP20293 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TP20293 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TP20293 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
TP20293 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
TP20293 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TP20293 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TP20293 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
TP20293 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TP20293 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TP20293 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TP20293 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TP20293 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TP20293 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TP20293 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TP20293 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TP20293 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TP20293 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TP20293 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TP20293 Ap5z1-201ENSMUST00000038699 3689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TP20293 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TP20293 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TP20293 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TP20293 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TP20293 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TP20293 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TP20293 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
TP20293 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
TP20293 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TP20293 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TP20293 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TP20293 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TP20293 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TP20293 Gm43014-201ENSMUST00000198568 2443 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
TP20293 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
TP20293 Ppp4r1l-ps-202ENSMUST00000132669 2767 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
TP20293 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
TP20293 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TP20293 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TP20293 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TP20293 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TP20293 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
TP20293 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TP20293 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
TP20293 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
TP20293 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TP20293 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
TP20293 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
TP20293 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
TP20293 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TP20293 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
TP20293 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TP20293 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TP20293 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
TP20293 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
TP20293 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
TP20293 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
TP20293 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
TP20293 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TP20293 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
TP20293 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
TP20293 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
TP20293 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TP20293 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
TP20293 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
TP20293 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
TP20293 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
TP20293 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TP20293 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
TP20293 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
TP20293 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TP20293 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TP20293 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TP20293 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TP20293 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TP20293 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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