Protein–RNA interactions for Protein: P0CG49

Ubb, Polyubiquitin-B, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbbP0CG49 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
UbbP0CG49 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
UbbP0CG49 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
UbbP0CG49 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
UbbP0CG49 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
UbbP0CG49 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
UbbP0CG49 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
UbbP0CG49 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
UbbP0CG49 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
UbbP0CG49 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
UbbP0CG49 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
UbbP0CG49 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
UbbP0CG49 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
UbbP0CG49 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
UbbP0CG49 Zmynd8-221ENSMUST00000177633 5093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
UbbP0CG49 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
UbbP0CG49 Asxl2-207ENSMUST00000153102 4462 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
UbbP0CG49 Hmgb2-201ENSMUST00000067925 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
UbbP0CG49 Gm13126-201ENSMUST00000117079 3063 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
UbbP0CG49 Afap1-201ENSMUST00000064571 6618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
UbbP0CG49 Vwf-203ENSMUST00000112254 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
UbbP0CG49 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
UbbP0CG49 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
UbbP0CG49 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
UbbP0CG49 Thbd-201ENSMUST00000099270 3723 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
UbbP0CG49 Ilf3-202ENSMUST00000115414 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
UbbP0CG49 Mlxipl-201ENSMUST00000005507 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
UbbP0CG49 Edaradd-201ENSMUST00000179308 6668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
UbbP0CG49 Gm38357-201ENSMUST00000195382 2464 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
UbbP0CG49 2410004P03Rik-201ENSMUST00000095823 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
UbbP0CG49 Plxna3-201ENSMUST00000004326 6943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
UbbP0CG49 Zfp384-201ENSMUST00000046064 3108 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
UbbP0CG49 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
UbbP0CG49 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
UbbP0CG49 Dido1-204ENSMUST00000103055 4613 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
UbbP0CG49 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
UbbP0CG49 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
UbbP0CG49 AL645745.1-201ENSMUST00000222202 5348 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
UbbP0CG49 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
UbbP0CG49 Peg10-201ENSMUST00000166678 6662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
UbbP0CG49 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
UbbP0CG49 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
UbbP0CG49 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
UbbP0CG49 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
UbbP0CG49 Bsdc1-201ENSMUST00000048162 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
UbbP0CG49 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
UbbP0CG49 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
UbbP0CG49 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
UbbP0CG49 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
UbbP0CG49 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
UbbP0CG49 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
UbbP0CG49 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
UbbP0CG49 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
UbbP0CG49 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
UbbP0CG49 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
UbbP0CG49 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
UbbP0CG49 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
UbbP0CG49 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
UbbP0CG49 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
UbbP0CG49 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
UbbP0CG49 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
UbbP0CG49 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
UbbP0CG49 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
UbbP0CG49 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
UbbP0CG49 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
UbbP0CG49 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
UbbP0CG49 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
UbbP0CG49 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
UbbP0CG49 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
UbbP0CG49 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
UbbP0CG49 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
UbbP0CG49 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
UbbP0CG49 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
UbbP0CG49 Zfp775-201ENSMUST00000061720 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
UbbP0CG49 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
UbbP0CG49 Aldh1a3-201ENSMUST00000015278 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
UbbP0CG49 Eif2ak4-201ENSMUST00000005233 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
UbbP0CG49 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
UbbP0CG49 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
UbbP0CG49 Gm42031-201ENSMUST00000209823 1885 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
UbbP0CG49 Slc6a9-202ENSMUST00000063857 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
UbbP0CG49 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
UbbP0CG49 Snd1-201ENSMUST00000001460 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
UbbP0CG49 Setbp1-201ENSMUST00000025430 9953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
UbbP0CG49 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
UbbP0CG49 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
UbbP0CG49 Dusp16-202ENSMUST00000129433 3993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
UbbP0CG49 Acss3-203ENSMUST00000165067 4696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
UbbP0CG49 Rnf2-201ENSMUST00000076110 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
UbbP0CG49 Clasp1-208ENSMUST00000187713 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
UbbP0CG49 BC035947-201ENSMUST00000170511 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
UbbP0CG49 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
UbbP0CG49 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
UbbP0CG49 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
UbbP0CG49 Adcy7-202ENSMUST00000168545 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
UbbP0CG49 Nampt-201ENSMUST00000020886 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
UbbP0CG49 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
UbbP0CG49 Gm44115-201ENSMUST00000203917 2069 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
UbbP0CG49 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
UbbP0CG49 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms