Protein–RNA interactions for Protein: P04213

T-cell receptor beta chain V region C5 (Fragment), mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04213 Ly6e-202ENSMUST00000169343 2154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P04213 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P04213 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P04213 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P04213 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P04213 Cdc20b-204ENSMUST00000181568 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P04213 Slc39a14-210ENSMUST00000152067 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P04213 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
P04213 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P04213 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P04213 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P04213 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P04213 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P04213 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P04213 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
P04213 Gm32111-201ENSMUST00000207689 846 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
P04213 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P04213 Klhl7-201ENSMUST00000030841 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P04213 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P04213 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P04213 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P04213 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
P04213 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P04213 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P04213 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P04213 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P04213 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P04213 Zc3hav1-201ENSMUST00000031850 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P04213 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P04213 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P04213 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P04213 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P04213 Exoc7-202ENSMUST00000106411 3205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P04213 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P04213 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P04213 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P04213 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P04213 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P04213 Eif2s3y-201ENSMUST00000091197 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P04213 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P04213 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P04213 Rps24-210ENSMUST00000225023 1613 ntAPPRIS P4 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P04213 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P04213 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P04213 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P04213 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P04213 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P04213 Gm12224-201ENSMUST00000124047 567 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P04213 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P04213 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P04213 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P04213 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P04213 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P04213 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P04213 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P04213 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P04213 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P04213 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P04213 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P04213 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P04213 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P04213 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P04213 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P04213 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P04213 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P04213 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P04213 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P04213 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P04213 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P04213 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P04213 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P04213 Dnajc14-202ENSMUST00000217745 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P04213 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P04213 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P04213 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P04213 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P04213 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P04213 Ccdc167-203ENSMUST00000129091 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P04213 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P04213 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P04213 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P04213 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P04213 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P04213 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P04213 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P04213 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P04213 Ppef2-202ENSMUST00000201130 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P04213 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P04213 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P04213 Aldh1a3-201ENSMUST00000015278 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P04213 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P04213 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P04213 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P04213 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P04213 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P04213 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
P04213 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P04213 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P04213 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P04213 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
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