Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Gm11735-201ENSMUST00000106377 1581 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Chp1-202ENSMUST00000119172 3027 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Ikbkb-201ENSMUST00000033939 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Ddx3x-201ENSMUST00000000804 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 9530059O14Rik-201ENSMUST00000181107 3978 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 B630019A10Rik-201ENSMUST00000149488 2407 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Morf4l2-201ENSMUST00000033797 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Gm42851-201ENSMUST00000201325 1411 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 4933408B17Rik-201ENSMUST00000056932 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Sgk3-203ENSMUST00000168907 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Sema4g-201ENSMUST00000026225 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Gmip-202ENSMUST00000123453 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Clec14a-201ENSMUST00000062254 4571 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Gm12570-201ENSMUST00000122047 1030 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Gm10643-201ENSMUST00000098592 1577 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Ccdc85a-206ENSMUST00000146385 3798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Nfkbiz-201ENSMUST00000036273 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Armc8-202ENSMUST00000185524 2820 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Psat1-205ENSMUST00000162053 2291 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Pigo-202ENSMUST00000098109 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms