Protein–RNA interactions for Protein: J3QPC3

BC024978, cDNA sequence BC024978, mousemouse

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Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC024978J3QPC3 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Gm26912-201ENSMUST00000180988 1483 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Gm5210-201ENSMUST00000182150 1010 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 AC167364.1-201ENSMUST00000221495 784 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 AC134793.1-202ENSMUST00000227444 803 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Cdc20b-204ENSMUST00000181568 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Gm5944-201ENSMUST00000118182 1001 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 E330021D16Rik-201ENSMUST00000058713 1116 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
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