Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Sbf2-205ENSMUST00000164759 7090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Eif4e1b-201ENSMUST00000110003 2131 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Gm25661-201ENSMUST00000157704 296 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Tctex1d1-201ENSMUST00000030248 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Disp2-201ENSMUST00000037547 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Sppl2c-202ENSMUST00000107000 2225 ntAPPRIS P4 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 AC117656.2-201ENSMUST00000224931 2215 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Sppl2c-201ENSMUST00000059448 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Gm42488-201ENSMUST00000197648 3225 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Sh3tc1-207ENSMUST00000201511 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Edil3-201ENSMUST00000043111 5156 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Zbtb8b-202ENSMUST00000106046 3323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Gpr156-201ENSMUST00000061274 4581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Gm1627-201ENSMUST00000188504 2588 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Platr9-202ENSMUST00000149572 1556 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 9130221F21Rik-201ENSMUST00000206867 2631 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 R3hdm2-205ENSMUST00000105251 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Phc1-215ENSMUST00000161739 3893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Cdkn1b-202ENSMUST00000067327 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Dpf2-205ENSMUST00000136983 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Acad10-202ENSMUST00000111770 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Tln2-207ENSMUST00000215784 8330 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Fam217a-202ENSMUST00000223834 2253 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Sorcs1-208ENSMUST00000211687 7080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Lrrn4cl-201ENSMUST00000096257 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Ubap2-201ENSMUST00000030143 4368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Gm19410-201ENSMUST00000207505 6352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Zfp532-201ENSMUST00000049016 5503 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Stard13-201ENSMUST00000062015 5526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
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Gm8005F6YKY3 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 H2-M9-202ENSMUST00000087167 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Prim1-201ENSMUST00000026461 1583 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Adat1-202ENSMUST00000120457 1677 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Gm37242-201ENSMUST00000191873 2085 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Erc2-205ENSMUST00000210135 6233 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Zfp60-208ENSMUST00000167955 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Supt20-201ENSMUST00000029315 2112 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Zcchc12-202ENSMUST00000115256 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 4933414I15Rik-201ENSMUST00000109123 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Gm10634-202ENSMUST00000188891 2464 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Pgbd5-206ENSMUST00000172566 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Pla2g4e-201ENSMUST00000090071 4477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Ppfia1-202ENSMUST00000182226 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Cdk12-201ENSMUST00000003203 4837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Cntrl-206ENSMUST00000113037 5970 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Cdc42bpa-203ENSMUST00000097453 6704 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
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