Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2C0

Cfap46, Cilia and flagella-associated protein 46, mousemouse

Predictions only

Length 2,641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap46E9Q2C0 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Lyrm1-202ENSMUST00000106516 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Rps23-ps1-201ENSMUST00000116115 425 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Gm15489-201ENSMUST00000132811 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Rps23-ps2-201ENSMUST00000146939 432 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Ifna11-201ENSMUST00000170428 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Gm20091-201ENSMUST00000179683 189 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 AC158518.1-201ENSMUST00000216435 320 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Gm5148-201ENSMUST00000079755 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Ifna1-201ENSMUST00000094972 570 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Klf10-203ENSMUST00000227920 2144 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Gm35963-201ENSMUST00000211762 1425 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Gm12072-201ENSMUST00000118293 715 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Gm8659-201ENSMUST00000120024 1084 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Gm12111-201ENSMUST00000150073 349 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Gm18555-201ENSMUST00000197935 584 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Rpl15-ps5-201ENSMUST00000205636 605 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Gpx4-ps2-201ENSMUST00000214811 555 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Gm5194-201ENSMUST00000221457 742 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Cypt2-201ENSMUST00000041758 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Rpl37-201ENSMUST00000045356 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Olfr403-201ENSMUST00000076675 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Olfr43-201ENSMUST00000078936 1092 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cfap46E9Q2C0 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cfap46E9Q2C0 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cfap46E9Q2C0 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cfap46E9Q2C0 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cfap46E9Q2C0 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cfap46E9Q2C0 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cfap46E9Q2C0 Dmtf1-201ENSMUST00000071921 3806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cfap46E9Q2C0 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cfap46E9Q2C0 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cfap46E9Q2C0 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cfap46E9Q2C0 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cfap46E9Q2C0 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cfap46E9Q2C0 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cfap46E9Q2C0 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Cfap46E9Q2C0 Ifna6-201ENSMUST00000105146 570 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cfap46E9Q2C0 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Cfap46E9Q2C0 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cfap46E9Q2C0 Gm3898-201ENSMUST00000180221 613 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cfap46E9Q2C0 Mir124-2hg-203ENSMUST00000186923 673 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cfap46E9Q2C0 Gm38301-201ENSMUST00000195573 543 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Cfap46E9Q2C0 Nudc-ps1-201ENSMUST00000209275 551 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Cfap46E9Q2C0 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cfap46E9Q2C0 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cfap46E9Q2C0 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cfap46E9Q2C0 3000002C10Rik-201ENSMUST00000125451 1614 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cfap46E9Q2C0 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cfap46E9Q2C0 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cfap46E9Q2C0 Atxn7l3-203ENSMUST00000107134 3712 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cfap46E9Q2C0 Gmeb2-201ENSMUST00000049032 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cfap46E9Q2C0 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cfap46E9Q2C0 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cfap46E9Q2C0 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cfap46E9Q2C0 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cfap46E9Q2C0 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cfap46E9Q2C0 Snx10-202ENSMUST00000114439 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cfap46E9Q2C0 Gm15033-201ENSMUST00000118188 673 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Cfap46E9Q2C0 Gm13002-201ENSMUST00000119286 682 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Cfap46E9Q2C0 1700095J12Rik-201ENSMUST00000124620 737 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cfap46E9Q2C0 Gm12853-201ENSMUST00000134971 442 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cfap46E9Q2C0 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Cfap46E9Q2C0 Gm16560-201ENSMUST00000159115 404 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Cfap46E9Q2C0 Gm20443-201ENSMUST00000173840 735 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cfap46E9Q2C0 Gm18733-202ENSMUST00000174447 401 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Cfap46E9Q2C0 Gm26119-201ENSMUST00000175601 104 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Cfap46E9Q2C0 Tspy-ps-203ENSMUST00000186546 989 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Cfap46E9Q2C0 Ighv5-12-4-201ENSMUST00000195381 353 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cfap46E9Q2C0 Gm44908-201ENSMUST00000208610 266 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms