Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hrh1-201ENSMUST00000088987 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pdpk1-202ENSMUST00000102927 7161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Khdrbs2-204ENSMUST00000188257 5278 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lig4-201ENSMUST00000095476 5028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mdm4-206ENSMUST00000186617 4694 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Epn2-203ENSMUST00000108712 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp423-203ENSMUST00000165770 4334 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Orc4-201ENSMUST00000028098 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Brpf1-208ENSMUST00000203577 4468 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Urb1-203ENSMUST00000140920 7344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Thsd7a-206ENSMUST00000172356 10998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29283-201ENSMUST00000187394 288 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr6-203ENSMUST00000213651 4457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Scml4-201ENSMUST00000063063 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp110-201ENSMUST00000004614 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16576-201ENSMUST00000128342 5404 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.2 ms