Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Eif4e1b-201ENSMUST00000110003 2131 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rnf217D3YYI7 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rnf217D3YYI7 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rnf217D3YYI7 Slc39a14-210ENSMUST00000152067 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rnf217D3YYI7 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rnf217D3YYI7 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rnf217D3YYI7 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rnf217D3YYI7 Pigo-202ENSMUST00000098109 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rnf217D3YYI7 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rnf217D3YYI7 A930007I19Rik-201ENSMUST00000180737 2319 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rnf217D3YYI7 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Rnf217D3YYI7 Pax6-206ENSMUST00000111086 2601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rnf217D3YYI7 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rnf217D3YYI7 Ilf3-201ENSMUST00000067646 3549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rnf217D3YYI7 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rnf217D3YYI7 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rnf217D3YYI7 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rnf217D3YYI7 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rnf217D3YYI7 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rnf217D3YYI7 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rnf217D3YYI7 Gm9220-201ENSMUST00000190721 2544 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Rnf217D3YYI7 Tfdp1-204ENSMUST00000209885 2511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rnf217D3YYI7 Ctage5-201ENSMUST00000021384 1628 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rnf217D3YYI7 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rnf217D3YYI7 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rnf217D3YYI7 Zfp943-201ENSMUST00000055349 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rnf217D3YYI7 Mical1-203ENSMUST00000119962 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rnf217D3YYI7 Mical1-201ENSMUST00000019967 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rnf217D3YYI7 Mpo-203ENSMUST00000121303 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rnf217D3YYI7 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rnf217D3YYI7 Gm14659-201ENSMUST00000117667 843 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Rnf217D3YYI7 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rnf217D3YYI7 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rnf217D3YYI7 Gm12718-202ENSMUST00000156144 660 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rnf217D3YYI7 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Rnf217D3YYI7 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Rnf217D3YYI7 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Rnf217D3YYI7 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Rnf217D3YYI7 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Rnf217D3YYI7 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rnf217D3YYI7 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rnf217D3YYI7 Gm39375-201ENSMUST00000217068 1039 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rnf217D3YYI7 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rnf217D3YYI7 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rnf217D3YYI7 Olfr225-201ENSMUST00000055276 1260 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rnf217D3YYI7 5930422O12Rik-201ENSMUST00000059351 840 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rnf217D3YYI7 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rnf217D3YYI7 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rnf217D3YYI7 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Rnf217D3YYI7 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rnf217D3YYI7 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rnf217D3YYI7 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rnf217D3YYI7 Uimc1-204ENSMUST00000127195 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rnf217D3YYI7 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rnf217D3YYI7 Sun1-205ENSMUST00000110883 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rnf217D3YYI7 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rnf217D3YYI7 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rnf217D3YYI7 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rnf217D3YYI7 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 Eif2ak4-203ENSMUST00000110869 1715 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 Atp13a4-201ENSMUST00000039090 2878 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 9430064I24Rik-201ENSMUST00000206516 2669 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 Gm3676-201ENSMUST00000111869 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 Gm5970-201ENSMUST00000131638 1216 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 Gm7255-201ENSMUST00000187371 908 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms