Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms