Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Ap1m2-201ENSMUST00000003397 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Lrtm2-201ENSMUST00000068351 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Gm28268-201ENSMUST00000188966 2528 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Atp11c-201ENSMUST00000033480 5939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Bsdc1-201ENSMUST00000048162 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Pop1-202ENSMUST00000079028 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Mpp1-202ENSMUST00000114091 1558 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Gm45699-201ENSMUST00000212838 1576 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Zfp330-201ENSMUST00000034147 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Lrrc49-204ENSMUST00000114034 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Apobec3-205ENSMUST00000175752 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Gosr2-201ENSMUST00000021329 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Ampd3-206ENSMUST00000170374 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Tro-201ENSMUST00000087253 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Elovl5-201ENSMUST00000034904 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Mdm4-206ENSMUST00000186617 4694 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Zfp605-202ENSMUST00000112528 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Zmym6-201ENSMUST00000046751 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Ptk2b-203ENSMUST00000111121 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Atp11c-202ENSMUST00000101527 6044 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Abcg1-201ENSMUST00000024829 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Afap1-201ENSMUST00000064571 6618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Gpi1-201ENSMUST00000038027 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Ppp6r2-201ENSMUST00000088788 2887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Cnppd1-202ENSMUST00000168720 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 4930432L08Rik-201ENSMUST00000132154 1608 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Oas1h-201ENSMUST00000072476 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Ubash3a-201ENSMUST00000048656 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Cacna2d1-204ENSMUST00000115281 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Lrfn5-202ENSMUST00000119481 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Mybpc3-201ENSMUST00000111430 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Tmprss2-201ENSMUST00000000395 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Ppef2-202ENSMUST00000201130 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Olfr95-201ENSMUST00000060728 5129 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Gm12570-201ENSMUST00000122047 1030 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 4930478P22Rik-202ENSMUST00000201921 723 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Gm32939-201ENSMUST00000222336 843 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Olfr553-201ENSMUST00000098222 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Phf8-202ENSMUST00000046962 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Adar-205ENSMUST00000121094 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Gm40634-201ENSMUST00000214129 2001 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.8 ms