Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

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Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Aamdc-206ENSMUST00000136757 789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Gm12052-201ENSMUST00000142151 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Treml4-206ENSMUST00000154335 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Gm16547-201ENSMUST00000159474 293 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Tex29-204ENSMUST00000166638 561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Gm23647-201ENSMUST00000175042 109 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Rn5s-201ENSMUST00000177555 119 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 n-R5s108-201ENSMUST00000177575 119 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 n-R5s121-201ENSMUST00000177589 119 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 n-R5s146-201ENSMUST00000177889 119 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Gm22109-201ENSMUST00000177995 119 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Gm22291-201ENSMUST00000178027 119 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 n-R5s141-201ENSMUST00000178066 119 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Gm23284-201ENSMUST00000178069 119 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 n-R5s100-201ENSMUST00000178106 119 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 n-R5s111-201ENSMUST00000178203 119 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 n-R5s105-201ENSMUST00000178499 119 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 n-R5s149-201ENSMUST00000178520 119 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 n-R5s103-201ENSMUST00000178755 119 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 n-R5s123-201ENSMUST00000178804 119 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 n-R5s142-201ENSMUST00000178820 119 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 n-R5s144-201ENSMUST00000178859 119 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 n-R5s139-201ENSMUST00000178975 119 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 n-R5s134-201ENSMUST00000178983 119 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 n-R5s136-201ENSMUST00000179080 119 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Gm25018-201ENSMUST00000179081 119 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 n-R5s104-201ENSMUST00000179107 119 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 n-R5s113-201ENSMUST00000179143 119 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 n-R5s133-201ENSMUST00000179275 119 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 n-R5s117-201ENSMUST00000179431 119 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Gm25212-201ENSMUST00000179432 119 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 n-R5s138-201ENSMUST00000179476 119 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 n-R5s122-201ENSMUST00000179500 119 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 n-R5s143-201ENSMUST00000179542 119 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 n-R5s107-201ENSMUST00000179704 119 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Gm26391-201ENSMUST00000179843 119 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 n-R5s110-201ENSMUST00000179995 119 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 n-R5s128-201ENSMUST00000180096 119 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 n-R5s124-201ENSMUST00000180334 119 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Plac9a-203ENSMUST00000183725 439 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Plac9b-202ENSMUST00000183811 396 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 P4htm-204ENSMUST00000193621 1297 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Gm37197-201ENSMUST00000195607 401 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Gm43460-201ENSMUST00000202491 1057 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Rpl15-ps5-201ENSMUST00000205636 605 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Gm18001-201ENSMUST00000212023 688 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Chordc1-202ENSMUST00000213605 519 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Olfr1015-201ENSMUST00000047870 1016 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Gm24089-201ENSMUST00000093696 109 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 AC022682.1-201ENSMUST00000224624 2023 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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Gm6880A3KG45 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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Gm6880A3KG45 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Gm23769-201ENSMUST00000104441 121 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Lemd1-201ENSMUST00000112357 964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Gm16288-201ENSMUST00000137940 367 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
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