Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ambra1A2AH22 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ambra1A2AH22 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ambra1A2AH22 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ambra1A2AH22 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ambra1A2AH22 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ambra1A2AH22 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ambra1A2AH22 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Ambra1A2AH22 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ambra1A2AH22 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ambra1A2AH22 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ambra1A2AH22 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ambra1A2AH22 Zfp830-201ENSMUST00000056677 1591 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Ambra1A2AH22 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ambra1A2AH22 Gm43625-201ENSMUST00000199177 1539 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ambra1A2AH22 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ambra1A2AH22 Babam2-202ENSMUST00000071531 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ambra1A2AH22 Gm5046-201ENSMUST00000100608 611 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ambra1A2AH22 Tnnt3-203ENSMUST00000105941 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ambra1A2AH22 Tnnt3-204ENSMUST00000105942 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ambra1A2AH22 Tnnt3-205ENSMUST00000105943 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ambra1A2AH22 Tnnt3-207ENSMUST00000105945 747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ambra1A2AH22 Tnnt3-208ENSMUST00000105946 765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ambra1A2AH22 Tomm5-203ENSMUST00000107809 738 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ambra1A2AH22 Mrps33-202ENSMUST00000114797 500 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ambra1A2AH22 Gm13580-201ENSMUST00000131457 566 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ambra1A2AH22 Gm25154-201ENSMUST00000157123 119 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ambra1A2AH22 1700028K03Rik-202ENSMUST00000159902 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ambra1A2AH22 Gm9513-201ENSMUST00000165591 306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ambra1A2AH22 Gm29593-201ENSMUST00000189827 620 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ambra1A2AH22 Gm38145-201ENSMUST00000192319 693 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ambra1A2AH22 Gm44460-201ENSMUST00000196179 129 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ambra1A2AH22 Gm40153-201ENSMUST00000197904 637 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ambra1A2AH22 Gm36287-201ENSMUST00000223481 796 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ambra1A2AH22 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ambra1A2AH22 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ambra1A2AH22 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ambra1A2AH22 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ambra1A2AH22 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ambra1A2AH22 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ambra1A2AH22 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ambra1A2AH22 Gm26953-209ENSMUST00000213051 2087 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ambra1A2AH22 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ambra1A2AH22 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ambra1A2AH22 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ambra1A2AH22 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ambra1A2AH22 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ambra1A2AH22 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ambra1A2AH22 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ambra1A2AH22 Gm26586-201ENSMUST00000181918 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ambra1A2AH22 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ambra1A2AH22 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ambra1A2AH22 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ambra1A2AH22 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ambra1A2AH22 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ambra1A2AH22 Bgn-207ENSMUST00000169489 1574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ambra1A2AH22 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ambra1A2AH22 Gm26912-201ENSMUST00000180988 1483 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ambra1A2AH22 Gm37582-201ENSMUST00000192953 1409 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ambra1A2AH22 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ambra1A2AH22 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ambra1A2AH22 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ambra1A2AH22 Mymk-201ENSMUST00000009358 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ambra1A2AH22 Sppl2c-201ENSMUST00000059448 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ambra1A2AH22 Gm14538-201ENSMUST00000122019 1327 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ambra1A2AH22 Gm24066-201ENSMUST00000104515 131 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ambra1A2AH22 Use1-203ENSMUST00000110054 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ambra1A2AH22 Gm13758-201ENSMUST00000118699 743 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ambra1A2AH22 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ambra1A2AH22 Spata3-205ENSMUST00000130504 1100 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ambra1A2AH22 C130080G10Rik-204ENSMUST00000155185 954 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ambra1A2AH22 Gm27168-201ENSMUST00000183394 361 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ambra1A2AH22 Mir6934-201ENSMUST00000183965 62 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ambra1A2AH22 B130024G19Rik-204ENSMUST00000191084 634 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ambra1A2AH22 Gm38004-201ENSMUST00000192972 357 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ambra1A2AH22 Gm8625-201ENSMUST00000194185 1077 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ambra1A2AH22 AC166061.1-201ENSMUST00000225163 1138 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ambra1A2AH22 Gm25483-201ENSMUST00000083224 227 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ambra1A2AH22 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ambra1A2AH22 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ambra1A2AH22 Armcx3-203ENSMUST00000086884 3488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ambra1A2AH22 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ambra1A2AH22 Dnaja1-201ENSMUST00000030118 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ambra1A2AH22 Morf4l2-215ENSMUST00000169418 1782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ambra1A2AH22 Gm9864-201ENSMUST00000090043 1656 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ambra1A2AH22 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ambra1A2AH22 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ambra1A2AH22 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ambra1A2AH22 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ambra1A2AH22 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ambra1A2AH22 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ambra1A2AH22 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ambra1A2AH22 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ambra1A2AH22 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ambra1A2AH22 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ambra1A2AH22 Gm16439-201ENSMUST00000100687 564 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ambra1A2AH22 Fgf1-203ENSMUST00000117566 418 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ambra1A2AH22 Maats1os-201ENSMUST00000133496 326 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ambra1A2AH22 Aif1l-207ENSMUST00000148056 670 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ambra1A2AH22 1700026D11Rik-205ENSMUST00000151417 789 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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