Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 Plcxd2-201ENSMUST00000130481 7140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 Zdbf2-201ENSMUST00000029025 12112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 Hspa12a-201ENSMUST00000066285 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 Ybey-201ENSMUST00000049185 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 Acot11-202ENSMUST00000102762 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 Nlgn1-205ENSMUST00000193603 11807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 Osmr-201ENSMUST00000022746 5491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 Zfp141-203ENSMUST00000174407 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 Il17rd-201ENSMUST00000035336 8280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 Eif2ak4-201ENSMUST00000005233 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 Svil-204ENSMUST00000127297 6243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 Serac1-202ENSMUST00000097432 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 Bicral-201ENSMUST00000040624 6579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 Bcorl1-203ENSMUST00000136348 7446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 Zfyve1-201ENSMUST00000048319 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 Itgad-202ENSMUST00000106237 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.8 ms