Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Hdac5Q9Z2V6 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Hdac5Q9Z2V6 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Hdac5Q9Z2V6 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Hdac5Q9Z2V6 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Hdac5Q9Z2V6 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Hdac5Q9Z2V6 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Hdac5Q9Z2V6 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Hdac5Q9Z2V6 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Hdac5Q9Z2V6 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Hdac5Q9Z2V6 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Hdac5Q9Z2V6 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
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Hdac5Q9Z2V6 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 AC151904.4-201ENSMUST00000219868 1319 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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