Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms