Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms