Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 1700009J07Rik-202ENSMUST00000185309 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Gm19927-201ENSMUST00000185792 781 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 1700001J11Rik-201ENSMUST00000185917 759 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 4930521E06Rik-201ENSMUST00000186732 905 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Gm20781-201ENSMUST00000193154 693 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Gm33571-201ENSMUST00000193271 657 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Gm19918-201ENSMUST00000194858 400 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Gm43489-201ENSMUST00000196810 993 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Gm21461-201ENSMUST00000200382 863 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Lrp1b-212ENSMUST00000204204 798 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Gm19885-201ENSMUST00000212853 343 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Gm18996-201ENSMUST00000214851 755 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 AC162938.2-202ENSMUST00000215497 722 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Aoah-202ENSMUST00000221982 919 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 AC131100.2-201ENSMUST00000227701 998 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Gpr87-201ENSMUST00000056898 1080 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Tnfrsf9-202ENSMUST00000060901 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Olfr843-201ENSMUST00000061365 1107 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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SrfQ9JM73 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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SrfQ9JM73 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Pex3-207ENSMUST00000170376 1381 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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SrfQ9JM73 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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SrfQ9JM73 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Gm25414-201ENSMUST00000101814 107 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
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SrfQ9JM73 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Gm13204-201ENSMUST00000120110 821 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
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SrfQ9JM73 Slc7a12-203ENSMUST00000120801 1069 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Mrpl24-204ENSMUST00000121920 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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SrfQ9JM73 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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SrfQ9JM73 4930578M01Rik-201ENSMUST00000180490 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 A630095E13Rik-202ENSMUST00000184611 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Gm20914-202ENSMUST00000188887 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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SrfQ9JM73 Plet1os-202ENSMUST00000190941 1119 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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SrfQ9JM73 Ppbp-201ENSMUST00000031319 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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SrfQ9JM73 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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SrfQ9JM73 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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