Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
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Usp12Q9D9M2 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Usp12Q9D9M2 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Usp12Q9D9M2 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Usp12Q9D9M2 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
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Usp12Q9D9M2 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Usp12Q9D9M2 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Usp12Q9D9M2 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Usp12Q9D9M2 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Usp12Q9D9M2 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Usp12Q9D9M2 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Usp12Q9D9M2 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Usp12Q9D9M2 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Usp12Q9D9M2 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
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