Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C4

Ifi35, Interferon-induced 35 kDa protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi35Q9D8C4 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Sfxn5-204ENSMUST00000113788 514 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Thyn1-202ENSMUST00000213683 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Dnajc14-202ENSMUST00000217745 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Lhx9-201ENSMUST00000019374 4937 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Nuggc-201ENSMUST00000079469 2567 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Colq-205ENSMUST00000150054 2867 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Capn3-202ENSMUST00000028749 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Ssrp1-209ENSMUST00000168266 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 AC126459.1-201ENSMUST00000214791 2123 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Zscan21-202ENSMUST00000080732 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 3000002C10Rik-201ENSMUST00000125451 1614 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Fcrl1-202ENSMUST00000163661 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Adam1b-201ENSMUST00000079368 3338 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Apobr-201ENSMUST00000039522 3685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Cyp51-201ENSMUST00000001507 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
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Ifi35Q9D8C4 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Ifi35Q9D8C4 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Acss3-203ENSMUST00000165067 4696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Gm7255-201ENSMUST00000187371 908 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Ifi35Q9D8C4 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Ifi35Q9D8C4 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Ifi35Q9D8C4 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Stx16-201ENSMUST00000044638 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Gemin8-202ENSMUST00000087169 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Mrpl51-201ENSMUST00000032485 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Ifi35Q9D8C4 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Ncmap-203ENSMUST00000105858 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Gad1-201ENSMUST00000094934 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Ptpn7-201ENSMUST00000049449 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Txndc16-203ENSMUST00000123879 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Ndrg4-202ENSMUST00000073139 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Pfkm-201ENSMUST00000051226 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Cngb1-204ENSMUST00000121162 3336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Cd200r2-201ENSMUST00000102805 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Sfi1-218ENSMUST00000153425 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Cckar-202ENSMUST00000200691 3230 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Gm43086-201ENSMUST00000202536 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Atxn1l-201ENSMUST00000093162 7526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Eci2-201ENSMUST00000021854 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms