Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Cldn22Q9D7U6 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Cldn22Q9D7U6 Pde4c-202ENSMUST00000110095 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Cldn22Q9D7U6 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Cldn22Q9D7U6 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Cldn22Q9D7U6 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Cldn22Q9D7U6 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Cldn22Q9D7U6 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Cldn22Q9D7U6 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Cldn22Q9D7U6 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Cldn22Q9D7U6 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
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Cldn22Q9D7U6 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
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