Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU5

Khdc3, KH domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc3Q9CWU5 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Als2-201ENSMUST00000027178 6342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Sall2-201ENSMUST00000058326 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Adcy7-202ENSMUST00000168545 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Peg10-203ENSMUST00000176551 6567 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Dchs2-201ENSMUST00000191829 10783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Rad51c-202ENSMUST00000067692 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Erbb3-201ENSMUST00000082059 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Wnk1-224ENSMUST00000203030 8163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Cacna1f-201ENSMUST00000115725 6028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Greb1l-201ENSMUST00000048977 8414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Olfr77-202ENSMUST00000217347 5980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Zfyve26-201ENSMUST00000021547 9391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Gm43636-201ENSMUST00000201501 2235 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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