Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Med12l-206ENSMUST00000199659 11006 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Shroom2-201ENSMUST00000062317 6997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Ccdc148-204ENSMUST00000226455 4612 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 4833418N02Rik-201ENSMUST00000137539 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Sirpa-204ENSMUST00000103203 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 A130010J15Rik-205ENSMUST00000178744 3782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Gm16387-201ENSMUST00000180990 2632 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Zfp324-201ENSMUST00000038701 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Celf1-205ENSMUST00000111449 4441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Zcchc12-202ENSMUST00000115256 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Inpp5b-201ENSMUST00000094782 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 H2-M10.3-201ENSMUST00000073546 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Celf5-202ENSMUST00000119060 4166 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Sec22c-201ENSMUST00000078547 5713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Atg16l2-201ENSMUST00000120267 6459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Col4a4-201ENSMUST00000087050 10108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Gm43086-201ENSMUST00000202536 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 9330175E14Rik-201ENSMUST00000180445 4852 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Arsb-201ENSMUST00000091403 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Son-204ENSMUST00000119368 7529 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Snd1-201ENSMUST00000001460 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Dip2c-202ENSMUST00000169960 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Zfp446-201ENSMUST00000045810 4615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Atxn2l-206ENSMUST00000206577 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Stra6-213ENSMUST00000167479 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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