Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Ppp2r2cos-201ENSMUST00000152862 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 Gm38312-201ENSMUST00000195426 1746 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 Gm12570-201ENSMUST00000122047 1030 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 Gm9372-201ENSMUST00000168454 430 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 Park2-203ENSMUST00000168593 735 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 Gm45388-201ENSMUST00000209922 1132 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 4930431F10Rik-201ENSMUST00000213122 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 Slc6a12-209ENSMUST00000171008 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 Fanca-202ENSMUST00000118395 3274 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 Zfp872-201ENSMUST00000091508 1395 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 Agbl4-202ENSMUST00000097920 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 Scgb2b27-203ENSMUST00000185399 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 Gm20781-201ENSMUST00000193154 693 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 Gm43097-201ENSMUST00000196867 151 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 Olfr1358-201ENSMUST00000204477 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 Klk1b15-ps-201ENSMUST00000206273 715 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 Olfr700-201ENSMUST00000079936 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 Arrb2-201ENSMUST00000079056 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 Wdr46-ps-201ENSMUST00000200591 1712 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 Mtch2-202ENSMUST00000111467 2281 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms