Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Gm5210-201ENSMUST00000182150 1010 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Gm7880-201ENSMUST00000203748 871 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 AC165249.1-202ENSMUST00000217990 734 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Gm3372-201ENSMUST00000198806 1792 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Rab28Q99KL7 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Gm42499-201ENSMUST00000196193 1412 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Gm32939-201ENSMUST00000222336 843 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
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