Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 March10-204ENSMUST00000138977 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 1600014C10Rik-202ENSMUST00000165308 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 1600014C10Rik-204ENSMUST00000178207 3341 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Gfra2-203ENSMUST00000227697 1323 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Marveld2-201ENSMUST00000022137 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Gckr-202ENSMUST00000201166 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Exoc7-202ENSMUST00000106411 3205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Gpi1-201ENSMUST00000038027 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Smpd4-218ENSMUST00000170273 2166 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Cdc20b-204ENSMUST00000181568 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Mdm1-203ENSMUST00000164077 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Osbpl7-206ENSMUST00000168565 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Sp100-201ENSMUST00000054279 1978 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 4930589P08Rik-201ENSMUST00000129097 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 CT009764.1-201ENSMUST00000222260 483 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Ppp6r2-201ENSMUST00000088788 2887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Gm15651-201ENSMUST00000159953 2507 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Hps4-202ENSMUST00000112359 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Adar-205ENSMUST00000121094 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Eif2s3y-201ENSMUST00000091197 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Pgf-201ENSMUST00000004913 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Fam13c-201ENSMUST00000062883 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 St6galnac4-201ENSMUST00000102818 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Gm44103-201ENSMUST00000204364 3662 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Cage1-203ENSMUST00000110233 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Gm16587-201ENSMUST00000161943 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Mipep-ps-201ENSMUST00000177439 291 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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