Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Vps33a-201ENSMUST00000031388 4235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Slc39a14-210ENSMUST00000152067 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Zfp111-202ENSMUST00000073833 3079 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Gm6092-201ENSMUST00000121659 2029 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Prc1-202ENSMUST00000163812 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Dhtkd1-201ENSMUST00000026924 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Aplp2-201ENSMUST00000072634 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Ampd3-206ENSMUST00000170374 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Nrros-204ENSMUST00000126869 2540 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Srpx2-201ENSMUST00000033606 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Cfap43-202ENSMUST00000095998 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Thbs3-202ENSMUST00000119084 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Mgme1-201ENSMUST00000028910 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Tmed5-205ENSMUST00000119437 3436 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Aoc1-201ENSMUST00000031835 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Arhgap17-202ENSMUST00000106442 3336 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Pax6-206ENSMUST00000111086 2601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Vil1-201ENSMUST00000027366 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Txlng-204ENSMUST00000112316 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Mcm3-201ENSMUST00000053266 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Ifi211-201ENSMUST00000009340 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Adar-205ENSMUST00000121094 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Scnn1a-201ENSMUST00000081440 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Suclg2-204ENSMUST00000204224 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Olfr1349-206ENSMUST00000213656 4492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 AC108416.1-201ENSMUST00000228755 1558 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Nlrx1-201ENSMUST00000034621 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 H2-M10.3-201ENSMUST00000073546 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Sgk3-204ENSMUST00000171265 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Pcdha4-201ENSMUST00000192295 4129 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Gckr-202ENSMUST00000201166 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Ppp1r3c-201ENSMUST00000087321 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Ube2l3-201ENSMUST00000090192 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Adgrl3-215ENSMUST00000120673 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Elf5-206ENSMUST00000164172 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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