Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2M3

Srrd, SRR1-like protein, mousemouse

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Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrdQ8K2M3 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SrrdQ8K2M3 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SrrdQ8K2M3 Lrsam1-201ENSMUST00000028132 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SrrdQ8K2M3 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SrrdQ8K2M3 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SrrdQ8K2M3 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SrrdQ8K2M3 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SrrdQ8K2M3 Gm37593-201ENSMUST00000191669 3254 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
SrrdQ8K2M3 Sept9-204ENSMUST00000106349 2932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SrrdQ8K2M3 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SrrdQ8K2M3 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SrrdQ8K2M3 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SrrdQ8K2M3 P3h1-202ENSMUST00000081606 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SrrdQ8K2M3 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SrrdQ8K2M3 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SrrdQ8K2M3 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SrrdQ8K2M3 Olfr222-202ENSMUST00000214351 2474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SrrdQ8K2M3 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SrrdQ8K2M3 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SrrdQ8K2M3 AC115746.1-201ENSMUST00000228949 3617 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
SrrdQ8K2M3 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SrrdQ8K2M3 Gm45132-201ENSMUST00000207234 2542 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
SrrdQ8K2M3 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SrrdQ8K2M3 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SrrdQ8K2M3 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SrrdQ8K2M3 Trav11-201ENSMUST00000103585 343 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SrrdQ8K2M3 Trav11d-201ENSMUST00000103648 342 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SrrdQ8K2M3 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
SrrdQ8K2M3 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SrrdQ8K2M3 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
SrrdQ8K2M3 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SrrdQ8K2M3 Gm13008-201ENSMUST00000142289 507 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SrrdQ8K2M3 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SrrdQ8K2M3 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SrrdQ8K2M3 Fcgr2b-203ENSMUST00000159688 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SrrdQ8K2M3 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SrrdQ8K2M3 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SrrdQ8K2M3 Vmn1r-ps63-201ENSMUST00000174565 989 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
SrrdQ8K2M3 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SrrdQ8K2M3 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
SrrdQ8K2M3 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SrrdQ8K2M3 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SrrdQ8K2M3 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
SrrdQ8K2M3 Trav11n-201ENSMUST00000200113 343 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
SrrdQ8K2M3 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
SrrdQ8K2M3 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SrrdQ8K2M3 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SrrdQ8K2M3 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SrrdQ8K2M3 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SrrdQ8K2M3 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SrrdQ8K2M3 Carhsp1-201ENSMUST00000008537 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SrrdQ8K2M3 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
SrrdQ8K2M3 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SrrdQ8K2M3 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SrrdQ8K2M3 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SrrdQ8K2M3 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SrrdQ8K2M3 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SrrdQ8K2M3 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SrrdQ8K2M3 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SrrdQ8K2M3 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SrrdQ8K2M3 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SrrdQ8K2M3 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
SrrdQ8K2M3 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
SrrdQ8K2M3 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SrrdQ8K2M3 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SrrdQ8K2M3 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SrrdQ8K2M3 Cntrl-201ENSMUST00000028235 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SrrdQ8K2M3 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SrrdQ8K2M3 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SrrdQ8K2M3 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SrrdQ8K2M3 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SrrdQ8K2M3 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SrrdQ8K2M3 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SrrdQ8K2M3 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SrrdQ8K2M3 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SrrdQ8K2M3 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SrrdQ8K2M3 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SrrdQ8K2M3 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SrrdQ8K2M3 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SrrdQ8K2M3 Gm22594-201ENSMUST00000104251 130 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SrrdQ8K2M3 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SrrdQ8K2M3 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SrrdQ8K2M3 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SrrdQ8K2M3 Gm12906-201ENSMUST00000154610 441 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SrrdQ8K2M3 1700006J14Rik-204ENSMUST00000161511 574 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SrrdQ8K2M3 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SrrdQ8K2M3 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SrrdQ8K2M3 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SrrdQ8K2M3 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SrrdQ8K2M3 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SrrdQ8K2M3 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SrrdQ8K2M3 Selenos-204ENSMUST00000206044 911 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SrrdQ8K2M3 BC049987-201ENSMUST00000213859 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SrrdQ8K2M3 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SrrdQ8K2M3 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SrrdQ8K2M3 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SrrdQ8K2M3 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SrrdQ8K2M3 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SrrdQ8K2M3 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SrrdQ8K2M3 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms