Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH19

Csnka2ip, Casein kinase II subunit alpha'-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnka2ipQ8CH19 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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