Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 Gm12570-201ENSMUST00000122047 1030 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 Gm12224-201ENSMUST00000124047 567 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Gm42851-201ENSMUST00000201325 1411 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Sgcg-202ENSMUST00000121148 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Gm16587-201ENSMUST00000161943 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Pramef8Q8CE24 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Pramef8Q8CE24 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms